Estão a tentar executar um comando STSADM e estão a ficar frustrados, porque recebem um "Command line error"? Estão convictos que o comando é perfeitamente válido e estão a ficar loucos, porque não está a ser interpretado correctamente? Não se preocupem, porque não estão sozinhos.
Felizmente, este problema e a sua solução já foram encontrados por várias pessoas. Se lerem o artigo SharePoint stsadm.exe and the infamous "Command line error" de Serge van den Oever, têm toda a informação de que precisam.
O problema está na codificação do texto. Parece que é possível obter diferentes codificações enquanto se escrevem comandos na mesma shell. Bastante estranho...
De qualquer forma, a solução é usar um editor de texto, escrever aí os comandos e certificarem-se que a codificação definida é ANSI. Podem depois copiar os comandos para a shell ou guardá-los num ficheiro batch.